Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfx1B1AY10 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfx1B1AY10 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nfx1B1AY10 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms