Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms