Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prr29B1ARI9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prr29B1ARI9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms