Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PP2D1A8MPX8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PP2D1A8MPX8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms