Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms