Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3P2A6NIE6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3P2A6NIE6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RRN3P2A6NIE6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms