Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBAL3A6NHL2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBAL3A6NHL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms