Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF25A6NGN4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms