Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRABD2BA6NFA1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABD2BA6NFA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms