Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gbp4A4UUI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4A4UUI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms