Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fibcd1A2AV25 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fibcd1A2AV25 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms