Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CtcflA2APF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtcflA2APF3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtcflA2APF3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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