Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hacd4A2AKM2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd4A2AKM2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms