Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a3A2ACT7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a3A2ACT7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms