Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf19bA2A7Q9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf19bA2A7Q9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf19bA2A7Q9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms