Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms