Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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