Protein–RNA interactions for Protein: V9GYS6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
V9GYS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
V9GYS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
V9GYS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
V9GYS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
V9GYS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
V9GYS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
V9GYS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
V9GYS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
V9GYS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
V9GYS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
V9GYS6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
V9GYS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
V9GYS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
V9GYS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
V9GYS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
V9GYS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
V9GYS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
V9GYS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
V9GYS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
V9GYS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
V9GYS6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
V9GYS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
V9GYS6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
V9GYS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
V9GYS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
V9GYS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
V9GYS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
V9GYS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
V9GYS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
V9GYS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
V9GYS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GYS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GYS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GYS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GYS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GYS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GYS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GYS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GYS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GYS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
V9GYS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
V9GYS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
V9GYS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
V9GYS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
V9GYS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
V9GYS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GYS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GYS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GYS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GYS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GYS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GYS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GYS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GYS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GYS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GYS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GYS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GYS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GYS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GYS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GYS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GYS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GYS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GYS6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GYS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GYS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GYS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms