Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQA8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQA8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQA8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQA8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQA8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U3KQA8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U3KQA8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
U3KQA8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U3KQA8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
U3KQA8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQA8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQA8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQA8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQA8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQA8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQA8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQA8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQA8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQA8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQA8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQA8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQA8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQA8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQA8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQA8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQA8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQA8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQA8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQA8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQA8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQA8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQA8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQA8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQA8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQA8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQA8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQA8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQA8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQA8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U3KQA8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U3KQA8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U3KQA8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U3KQA8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U3KQA8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
U3KQA8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U3KQA8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U3KQA8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQA8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQA8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQA8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQA8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQA8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQA8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQA8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQA8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQA8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQA8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQA8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQA8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQA8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQA8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U3KQA8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U3KQA8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U3KQA8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U3KQA8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U3KQA8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U3KQA8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U3KQA8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U3KQA8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U3KQA8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U3KQA8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U3KQA8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U3KQA8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U3KQA8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms