Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dctn3Q9Z0Y1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dctn3Q9Z0Y1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dctn3Q9Z0Y1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Dctn3Q9Z0Y1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dctn3Q9Z0Y1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.5 ms