Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CAMTA1Q9Y6Y1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CAMTA1Q9Y6Y1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CAMTA1Q9Y6Y1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CAMTA1Q9Y6Y1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms