Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC61Q9Y6R9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC61Q9Y6R9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC61Q9Y6R9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.5 ms