Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
MAP3K4Q9Y6R4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MAP3K4Q9Y6R4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms