Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NCOA3Q9Y6Q9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms