Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPG1Q9Y678 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPG1Q9Y678 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG1Q9Y678 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms