Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB4Q9Y5E5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB4Q9Y5E5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB4Q9Y5E5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms