Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP4S1Q9Y587 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms