Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXND1Q9Y4D7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms