Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C7

MED31, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED31Q9Y3C7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED31Q9Y3C7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED31Q9Y3C7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MED31Q9Y3C7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED31Q9Y3C7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED31Q9Y3C7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED31Q9Y3C7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED31Q9Y3C7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED31Q9Y3C7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms