Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP8A1Q9Y2Q0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.8 ms