Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS9D1Q9Y2B5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1Q9Y2B5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1Q9Y2B5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms