Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUDCQ9Y266 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUDCQ9Y266 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NUDCQ9Y266 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 371.2 ms