Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolbQ9WVP6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms