Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme3Q9WV85 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nme3Q9WV85 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme3Q9WV85 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms