Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bgrQ9WUZ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bgrQ9WUZ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms