Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc2Q9WUK4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc2Q9WUK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms