Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Vmn1r49Q9WUF1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r49Q9WUF1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Vmn1r49Q9WUF1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Vmn1r49Q9WUF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Vmn1r49Q9WUF1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r49Q9WUF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms