Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CEP164Q9UPV0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CEP164Q9UPV0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CEP164Q9UPV0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
CEP164Q9UPV0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
CEP164Q9UPV0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CEP164Q9UPV0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
CEP164Q9UPV0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CEP164Q9UPV0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CEP164Q9UPV0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
CEP164Q9UPV0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CEP164Q9UPV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CEP164Q9UPV0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CEP164Q9UPV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CEP164Q9UPV0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms