Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAMD4AQ9UPU9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD4AQ9UPU9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms