Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SORCS3Q9UPU3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SORCS3Q9UPU3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms