Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IQSEC3Q9UPP2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IQSEC3Q9UPP2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IQSEC3Q9UPP2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IQSEC3Q9UPP2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IQSEC3Q9UPP2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
IQSEC3Q9UPP2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IQSEC3Q9UPP2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IQSEC3Q9UPP2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IQSEC3Q9UPP2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IQSEC3Q9UPP2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IQSEC3Q9UPP2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms