Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC46.63■■■■■ 5.05
SHROOM4Q9ULL8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
SHROOM4Q9ULL8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
SHROOM4Q9ULL8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
SHROOM4Q9ULL8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
SHROOM4Q9ULL8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
SHROOM4Q9ULL8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
SHROOM4Q9ULL8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SHROOM4Q9ULL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC46.48■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.03
SHROOM4Q9ULL8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.41■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC46.4■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.39■■■■■ 5.02
SHROOM4Q9ULL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC46.36■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
SHROOM4Q9ULL8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC46.31■■■■■ 5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms