Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID1Q9ULK0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID1Q9ULK0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRID1Q9ULK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRID1Q9ULK0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRID1Q9ULK0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRID1Q9ULK0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRID1Q9ULK0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms