Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF346Q9UL40 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF346Q9UL40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF346Q9UL40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF346Q9UL40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF346Q9UL40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms