Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VAV3Q9UKW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VAV3Q9UKW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV3Q9UKW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAV3Q9UKW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 561.6 ms