Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC9Q9UKV0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC9Q9UKV0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms