Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD2Q9UKL4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJD2Q9UKL4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD2Q9UKL4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms