Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APPL1Q9UKG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL1Q9UKG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms