Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSKSQ9UJT2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSKSQ9UJT2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSKSQ9UJT2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms