Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPXQ9UHP9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms